近期Cell杂志上,来自美国斯坦福大学,洛克菲勒大学,加州大学伯克利分校等处的几位著名科学家发表了多篇有关系统生物学(Systems biology)的文章,探讨这一领域未来的发展。其中来自洛克菲勒大学细胞生物学家,2001年诺贝尔医学奖获得者Paul Nurse在题为“The Cell in the Era of System Biology(系统生物学时代的细胞学)”的文章中,在谈及细菌的系统生物学最近取得的巨大进展时,文章直接正面引用了我校何正国教授团队关于结核杆菌蛋白质网络的研究工作。
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2010年底何正国教授团队率先完成了结核杆菌的全局性蛋白质相互作用网络研究,成功发现了8000多对相互作用,成为目前针对这种能够引起人类结核病的细菌采用实验方法绘制的最大的网络,该成果已经以博士生王毅和崔涛为第一作者去年发表在国际著名杂志《蛋白质组学杂志》上。系统生物学是在各种组学的基础上新发展起来的一个新兴研究领域,由于它是从整体和全局性的层面上对一个细胞或组织开展系统性的研究,产生的信息量特别大,同时对于系统揭示细胞信号通路和发现新的靶标基因具有重要意义,因而是当前生命科学研究中一个十分前沿的热点领域。
Paul Nurse教授认为,系统生物学对于全面提高我们对细胞的认识将产生难以估量的影响。该评论文章一共仅引用了54篇文献,其中有40篇是在Cell, Nature和Science杂志(也称CNS杂志)上发表的文章。而在谈到细菌的系统生物学研究最近所取得的重要进展时,仅引用了何正国教授团队的一篇文章。
系统生物学是研究一个生物系统中所有组成成分(基因、mRNA、蛋白质等)的构成,以及在特定条件下这些组分间的相互关系的学科。也就是说,系统生物学不同于以往的实验生物学——仅关心个别的基因和蛋白质,它要研究所有的基因、所有的蛋白质、组分间的所有相互关系。
所以说,系统生物学不是蛋白质组学、基因组学、转录本组学或代谢组学,但是现阶段流行的这些生命科学领域都与系统生物学密切相关。正是在基因组学、蛋白质组学等新型大科学发展的基础上,孕育了系统生物学。反之,系统生物学的诞生进一步提升了后基因组时代的生命科学研究能力。
来源:生物通
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