柯萨奇病毒A16型(CAV-16)核酸扩增检测试剂盒(PCR-荧光探针法)-分析方法-资讯-生物在线

柯萨奇病毒A16型(CAV-16)核酸扩增检测试剂盒(PCR-荧光探针法)

作者:北京索奥生物医药科技有限公司 2008-05-09T00:00 (访问量:8759)

 

】                                                                   

中文名:柯萨奇病毒A16型(CAV-16)核酸扩增检测试剂盒

英文名:Coxsackievirus type A16 Fluorescence Quantitative Polymerase Chain Reaction (PCR) Diagnostic Kit

汉语拼音:ke sa qi bing A16 xing he suan kuo zeng jian ce shi ji he

 

【目的】

本试剂盒适用于检测疑似患者粪便、咽拭子标本、疱疹液或脑脊液等标本中柯萨奇病毒A16型(CAV-16)mRNA,适用于柯萨奇病毒A16型(CAV-16)感染引起的手足口病的辅助诊断。其检测结果仅供参考。

 

原理

本试剂盒用Trizol提取柯萨奇病毒A16型(CAV-16)mRNA,经过逆转录作用生成cDNA,用一对柯萨奇病毒A16型(CAV-16)特异性引物结合一条特异性荧光探针,配以FQ-Buffer(内含Mg2+、Tris-HCl等)、耐热DNA聚合酶(Taq酶)、四种核苷酸单体(dNTPs)等成分,通过一步PCR-荧光探针体外扩增法对柯萨奇病毒A16型(CAV-16)RNA进行扩增,从而达到快速实时定量检测之目的。

 

组成

名      称

数      量

规      格

CAV-16 PCR MIX

1    管

800μl/管

酶反应系

1    管

80μl/管

CAV-16阳性质控品

1    管

100μl/管(1×107Copies/ml)

阴性质控品

1    管

250μl/管

DEPC水

1    管

2000μl/管

备注:Trizol等另行配备

【标本采集】

1. 适用标本类型:疑似病人粪便、咽拭子标本、疱疹液、脑脊液或病毒分离培养物标本等

2. 标本采集:  

咽拭子标本:采集病人发病3日内的咽拭子标本,用专用采样棉签,适度用力拭抹咽后壁和两侧扁桃体部位,应避免触及舌部;迅速将棉签放入装有3~5ml保存液(维持液或生理盐水)的采样管中,在靠近顶端处折断棉签杆,旋紧管盖并密闭送检。

疱疹液:用75%的酒精对疱疹周围的皮肤进行消毒,然后用消毒针将疱疹挑破用棉签蘸取疱疹液,迅速将棉签放入内装有3~5ml保存液(维持液或生理盐水)的采样管中,在靠近顶端处折断棉签杆,旋紧管盖并密封。

脑脊液标本:出现神经系统症状后3天内,采集量为1.0~2.0ml。采集后立即装入无菌带垫圈的冻存管中。密闭送检测。

粪便:用灭菌捻拭子拭取粪便或腹泻物置入无菌玻璃管(含0.4ml 灭菌生理盐水),用无菌棉球将试管塞紧后,密闭送检。

 

【保存和运输】上述标本短期内可保存于-20℃,长期保存可置-70℃,但不能超过6个月,标本运送应采用0℃冰壶,采集标本应立即(12h内)送达实验室。

 

适用仪器】主要包括ABI GeneAmp PCR System7700、ABI GeneAmp PCR System7500, ABI PRISM 7300, LightCycler等,LightCycler等毛细管的仪器,MJ Opticon系列或取得资格认证的定量PCR仪。

 

使用方法

1.RNA提取

1.1样品处理

取50ul样品(或阴性质控品)加入150 ul Trizol reagents(RNA提取液)充分震荡,室温放置10min。

1.2.加入100ul氯仿,用力震荡15s,室温静置5min, 4℃ 12,000rpm离心10min。

1.3.小心将上层水相转移到干净离心管中,加等体积异丙醇,充分混匀,12,000rpm离心10min。

1.4.弃上清,加入500 ul 75%的DEPC乙醇,充分混匀,12,000rpm离心10min,小心吸去大部分乙醇。

1.5.将提取管敞口在室温空气中干燥5min待乙醇挥发干净,用20µl DEPC H2O溶解沉淀。

CAV-16阳性质控品:直接取3μl进行PCR扩增。

 

2.PCR扩增

从试剂盒中取出CAV-16-PCR MIX酶反应系,室温融化并振荡混匀后,10,000rpm离心10s。

设所需要的PCR反应管管数为N(N=样本数+1管阴性对照+1管阳性对照),每个测试反应体系配制如下表:

试剂

CAV-16 -PCR MIX

酶反应系

用量

20μl

2μl

计算好各试剂的使用量,加入一适当体积洁净0.2ml离心管中,充分混匀,10,000rpm离心10s,向设定的N个PCR反应管中分别加入22μl,向每管中加入处理后样品(提取RNA)或CAV-16-阳性质控品阴性质控品3μl,10,000rpm瞬时离心10秒。将各反应管放入定量PCR仪器的反应槽内,按对应顺序设置阴性质控品,阳性质控品以及未知标本,并设置样品名称、标记荧光基团种类(报告基团FAM、猝灭基团TAMRA)和循环条件:

ABI PRISM 7700,ABI PRISM5700,ABI GeneAmp 7000 (需要剪掉反应盖),ABI PRISM7300/7500(使用8联管),MJ Opticon(使用8联管)等使用薄壁管的仪器:循环条件: 30℃→5min,42℃→45分钟,后93℃→2分钟,后93℃ 30秒→55℃ 45秒, 40个循环。

LightCycler等使用毛细管的仪器: 循环条件: 30℃→5min,42℃→45分钟,93℃→2分钟,后93℃ 5秒→58℃ 45秒,共40个循环。

 

3. 结果分析判定

Ct 值小于37个循环的为阳性;Ct 值在37-40个循环之间,为灰区,需要进行重复试验。重复试验之后,如果Ct 值仍然在37-40个循环之间,判断为阳性,没有荧光值增长为阴性(<5×102Copies)。

 

质控标准

阴性质控品:全部阴性

CAV-16-阳性标准品:阳性对照的 Ct 值均应小于 30.0,且呈标准S型扩增曲线。

以上条件应同时满足,否则,此次试验视为无效,全部试验应重新进行。

 

注意事项

初次使用前请仔细阅读说明书。并严格按照说明书操作进行。

所有使用的离心管应高压灭菌(推荐使用,而且必须不含RNA酶。

PCR操作应严格按照要求分区(试剂配制区、标本处理区、PCR扩增区等),防止实验室污染。

试剂盒里不同组分不能混用。每盒试剂请于3 次内使用完毕。

所有试剂及待检标本应看作是传染物质。

 

【规格】40份/盒。

 

【贮藏及有效期】试剂盒应-20℃闭光保存,避免反复冻融。有效期10个月。

 

【生产企业】      公司名称:北京索奥生物技术有限公司

免费客户服务电话: 800-706-0910

电子邮箱:Order@suoaobio.com

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地 址: 北京市中关村丰台科技园航丰路8号B座

联系人: 虢红路

电 话: (010)58051371、58051372、58051373

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Email:suoaobio@yahoo.com.cn

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